HAVCR1

HAVCR1
Доступные структуры PDB Поиск по базе UniProt: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 5DZO, 5F70
Идентификаторы
Псевдонимы	HAVCR1, HAVCR, HAVCR-1, KIM-1, KIM1, TIM, TIM-1, TIM1, TIMD-1, TIMD1, CD365, hepatitis A virus cellular receptor 1
Внешние ID	OMIM: 606518 HomoloGene: 134424 GeneCards: HAVCR1
Расположение гена (человек) Хр. 5-я хромосома человека[1] Локус 5q33.3 Начало 157,029,413 bp[1] Конец 157,059,119 bp[1]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в sural nerve н/д Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция virus receptor activity Компонент клетки часть мембраны motile cilium мембрана Биологический процесс вирусный процесс viral entry into host cell Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 26762 н/д Ensembl ENSG00000113249 н/д UniProt Q96D42 н/д RefSeq (мРНК) NM_001099414 NM_001173393 NM_001308156 NM_012206 н/д RefSeq (белок) NP_001166864 NP_001295085 NP_036338 н/д Локус (UCSC) Chr 5: 157.03 – 157.06 Mb н/д Поиск по PubMed Искать[2] н/д
Информация в Викиданных
Смотреть (человек)

HAVCR1, или TIM-1 (англ. Hepatitis A virus cellular receptor 1, или англ. T-cell immunoglobulin and mucin domain 1 (TIM-1) ) — мембранный белок, продукт гена HAVCR1^[3][4][5]. Член семейства белков TIM (T cell transmembrane, immunoglobulin, and mucin), которые играют критическую роль в регулировании активности иммунных клеток, в особенности в ответ на вирусную инфекцию. Семейство включает 8 генов (от TIM-1 до TIM-8), из которых у человека присутствуют 3: TIM-1, TIM-3 и TIM-4. Кроме этого, белок участвует в процессах аллергического ответа, астмы и толерантности к транспланту.

Функции

Белки семейства TIM являются гликопротеинами клеточной поверхности, в структуре которых присутствуют иммуноглобулино-подобный домен, муциновый домен определённой длины, один трансмембранный домен и короткий C-концевой цитоплазматический фрагмент.

TIM-1 экспрессирован преимущественно на клетках Th2 и действует как стимулирующая молекула в процессе активации T-лимфоцитов^[6]. TIM-3 находится на клетках Th1 и Tc1 и функционирует как ингибиторный белок, который опосредует апоптоз этих клеток^[7]. TIM-4 представлен на антигенпредставляющих клетках и модулирует фагоцитоз апоптозных клетеок за счёт взаимодействия с фосфатидилсерином клеточной мембраны апоптозных клеток^[8].

Структура

Белок состоит из 364 аминокислот, молекулярная масса — 39,25 кДа. Это мембранный белок, содержит единственный трансмембранный участок. Содержит иммуноглобулиновый домен V-типа и домен с 12 аминокислотными повторами (V-P-T-T-T-T).

Примечания

Литература

• Kumanogoh A., Kikutani H. Immune semaphorins: a new area of semaphorin research (англ.) // Journal of Cell Science^[англ.] : journal. — The Company of Biologists^[англ.], 2004. — Vol. 116, no. Pt 17. — P. 3463—3470. — doi:10.1242/jcs.00674. — PMID 12893810.
• McIntire J. J., Umetsu D. T., DeKruyff R. H. TIM-1, a novel allergy and asthma susceptibility gene (англ.) // Springer Seminars in Immunopathology : journal. — 2004. — Vol. 25, no. 3—4. — P. 335—348. — doi:10.1007/s00281-003-0141-3. — PMID 15007635.
• Thompson P., Lu J., Kaplan G. G. The Cys-rich region of hepatitis A virus cellular receptor 1 is required for binding of hepatitis A virus and protective monoclonal antibody 190/4 (англ.) // Journal of Virology^[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 72, no. 5. — P. 3751—3761. — PMID 9557657. — PMC 109597.
• Bailly V., Zhang Z., Meier W., Cate R., Sanicola M., Bonventre J. V. Shedding of kidney injury molecule-1, a putative adhesion protein involved in renal regeneration (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 42. — P. 39739—39748. — doi:10.1074/jbc.M200562200. — PMID 12138159.
• Noguchi E., Nakayama J., Kamioka M., Ichikawa K., Shibasaki M., Arinami T. Insertion/deletion coding polymorphisms in hHAVcr-1 are not associated with atopic asthma in the Japanese population (англ.) // Genes and Immunity^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 4, no. 2. — P. 170—173. — doi:10.1038/sj.gene.6363935. — PMID 12618867.
• McIntire J. J., Umetsu S. E., Macaubas C., Hoyte E. G., Cinnioglu C., Cavalli-Sforza L. L., Barsh G. S., Hallmayer J. F., Underhill P. A., Risch N. J., Freeman G. J., DeKruyff R. H., Umetsu D. T. Immunology: hepatitis A virus link to atopic disease (англ.) // Nature : journal. — 2003. — Vol. 425, no. 6958. — P. 576. — doi:10.1038/425576a. — Bibcode: 2003Natur.425..576M. — PMID 14534576.
• Chae S. C., Song J. H., Heo J. C., Lee Y. C., Kim J. W., Chung H. T. Molecular variations in the promoter and coding regions of human Tim-1 gene and their association in Koreans with asthma (англ.) // Human Immunology^[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 64, no. 12. — P. 1177—1182. — doi:10.1016/j.humimm.2003.09.011. — PMID 14630400.
• Chae S. C., Song J. H., Lee Y. C., Kim J. W., Chung H. T. The association of the exon 4 variations of Tim-1 gene with allergic diseases in a Korean population (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications^[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 312, no. 2. — P. 346—350. — doi:10.1016/j.bbrc.2003.10.125. — PMID 14637143.
• Vilà M. R., Kaplan G. G., Feigelstock D., Nadal M., Morote J., Porta R., Bellmunt J., Meseguer A. Hepatitis A virus receptor blocks cell differentiation and is overexpressed in clear cell renal cell carcinoma (англ.) // Kidney International^[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 65, no. 5. — P. 1761—1773. — doi:10.1111/j.1523-1755.2004.00601.x. — PMID 15086915.
• Mesri M., Smithson G., Ghatpande A., Chapoval A., Shenoy S., Boldog F., Hackett C., Pena C. E., Burgess C., Bendele A., Shimkets R. A., Starling G. C. Inhibition of in vitro and in vivo T cell responses by recombinant human Tim-1 extracellular domain proteins (англ.) // International Immunology^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 18, no. 3. — P. 473—484. — doi:10.1093/intimm/dxh388. — PMID 16481347.
• Lim J., Hao T., Shaw C., Patel A. J., Szabó G., Rual J. F., Fisk C. J., Li N., Smolyar A., Hill D. E., Barabási A. L., Vidal M., Zoghbi H. Y. A protein-protein interaction network for human inherited ataxias and disorders of Purkinje cell degeneration (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2006. — Vol. 125, no. 4. — P. 801—814. — doi:10.1016/j.cell.2006.03.032. — PMID 16713569.
• Kotsis F., Nitschke R., Boehlke C., Bashkurov M., Walz G., Kuehn E. W. Ciliary calcium signaling is modulated by kidney injury molecule-1 (Kim1) (англ.) // Pflügers Archiv^[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 453, no. 6. — P. 819—829. — doi:10.1007/s00424-006-0168-0. — PMID 17205356.