CD164

CD164
Идентификаторы
ПсевдонимыCD164, MGC-24, MUC-24, endolyn, DFNA66, CD164 molecule, MGC-24v
Внешние IDOMIM: 603356 MGI: 1859568 HomoloGene: 38129 GeneCards: CD164
Расположение гена (человек)
6-я хромосома человека
Хр.6-я хромосома человека[1]
6-я хромосома человека
Расположение в геноме CD164
Расположение в геноме CD164
Локус6q21Начало109,366,514 bp[1]
Конец109,382,467 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
10-я хромосома мыши
Хр.10-я хромосома мыши[2]
10-я хромосома мыши
Расположение в геноме CD164
Расположение в геноме CD164
Локус10 B2|10 22.46 cMНачало41,395,410 bp[2]
Конец41,407,044 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • bronchial epithelial cell

  • secondary oocyte

  • corpus epididymis

  • metanephric glomerulus

  • caput epididymis
Наибольшая экспрессия в
  • conjunctival fornix
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
  • связывание с белками плазмы
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • внеклеточная область
  • lysosomal membrane
  • эндосома
  • клеточная мембрана
  • лизосома
  • часть клеточной мембраны
  • endosome membrane
  • мембрана
  • цитоплазматическая везикула
Биологический процесс
  • multicellular organism development
  • negative regulation of cell adhesion
  • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
  • агрегация клеток
  • развитие мышечного органа
  • иммунный ответ
  • передача сигнала
  • негативная регуляция пролиферации клеток
  • гемопоэз
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

8763

53599

Ensembl

ENSG00000135535

ENSMUSG00000019818

UniProt

Q04900

Q9R0L9

RefSeq (мРНК)
NM_006016
NM_001142401
NM_001142402
NM_001142403
NM_001142404

NM_001346500

NM_016898

RefSeq (белок)
NP_001135873
NP_001135874
NP_001135875
NP_001135876
NP_001333429

NP_006007

NP_058594

Локус (UCSC)Chr 6: 109.37 – 109.38 MbChr 10: 41.4 – 41.41 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

CD164 (англ. Sialomucin core protein 24) — мембранный белок, сиаломуцин, продукт гена человека CD164[5][6] Функционирует как молекула клеточной адгезии.

Функции

Сиаломуцины — гетерогенная группа секретируемых или мембрано-связанных муцинов, играющих две ключевых и противоположных ролей in vivo. Они могут быть протективными и антиадгезивными агентами или, наоборот, рецепторами адгезии. CD164 — интегральный трансмембранный сиаломуцин, функционирующий как рецептор адгезии[5]. Участвует в процессах адгезии клеток фенотипа CD34+, а также в пролиферации гемопоэтических клеток.

Белок экспрессирован на эпителии, моноцитах, клетках стромы костного мозга. В патологии может играть важную роль в метастазировании при раке предстательной железы и инфильтрации костного мозга раковыми клетками[7].

Структура

CD164 состоит из 197 аминокислот, молекулярная масса белка 21 кДа, зрелый гликозилированный белок имеет молекулярную массу 80 кДа. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию 5 изоформ белка.

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135535 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019818 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ 1 2 Watt SM, Bühring HJ, Rappold I, Chan JY, Lee-Prudhoe J, Jones T, Zannettino AC, Simmons PJ, Doyonnas R, Sheer D, Butler LH (August 1998). "CD164, a novel sialomucin on CD34(+) and erythroid subsets, is located on human chromosome 6q21". Blood. 92 (3): 849—66. doi:10.1182/blood.V92.3.849. PMID 9680353.
  6. ↑ Zannettino AC, Bühring HJ, Niutta S, Watt SM, Benton MA, Simmons PJ (October 1998). "The sialomucin CD164 (MGC-24v) is an adhesive glycoprotein expressed by human hematopoietic progenitors and bone marrow stromal cells that serves as a potent negative regulator of hematopoiesis". Blood. 92 (8): 2613—28. doi:10.1182/blood.V92.8.2613. PMID 9763543.
  7. ↑ Система маркёрных антигенов CD  (неопр.). vmede.org. Дата обращения: 11 марта 2021. Архивировано 15 октября 2018 года.  (рус.)

Литература

  • Zannettino AC (2001). "CD164". J. Biol. Regul. Homeost. Agents. 15 (4): 394—6. PMID 11862985.
  • Masuzawa Y, Miyauchi T, Hamanoue M, et al. (1992). "A novel core protein as well as polymorphic epithelial mucin carry peanut agglutinin binding sites in human gastric carcinoma cells: sequence analysis and examination of gene expression". J. Biochem. 112 (5): 609—15. doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123948. PMID 1478919.
  • Zhou GQ, Zhang Y, Ferguson DJ, et al. (2006). "The Drosophila ortholog of the endolysosomal membrane protein, endolyn, regulates cell proliferation". J. Cell. Biochem. 99 (5): 1380—96. doi:10.1002/jcb.20965. PMID 16924678. S2CID 6995864.
  • Chan JY, Lee-Prudhoe JE, Jorgensen B, et al. (2001). "Relationship between novel isoforms, functionally important domains, and subcellular distribution of CD164/endolyn". J. Biol. Chem. 276 (3): 2139—52. doi:10.1074/jbc.M007965200. PMID 11027692.
  • Ganesh SK, Zakai NA, van Rooij FJ, et al. (2009). "Multiple loci influence erythrocyte phenotypes in the CHARGE Consortium". Nat. Genet. 41 (11): 1191—8. doi:10.1038/ng.466. PMC 2778265. PMID 19862010.
  • Barbe L, Lundberg E, Oksvold P, et al. (2008). "Toward a confocal subcellular atlas of the human proteome". Mol. Cell. Proteomics. 7 (3): 499—508. doi:10.1074/mcp.M700325-MCP200. PMID 18029348.
  • Kurosawa N, Kanemitsu Y, Matsui T, et al. (1999). "Genomic analysis of a murine cell-surface sialomucin, MGC-24/CD164". Eur. J. Biochem. 265 (1): 466—72. doi:10.1046/j.1432-1327.1999.00777.x. PMID 10491205.
  • Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, et al. (2003). "The DNA sequence and analysis of human chromosome 6". Nature. 425 (6960): 805—11. Bibcode:2003Natur.425..805M. doi:10.1038/nature02055. PMID 14574404.
  • Doyonnas R, Yi-Hsin Chan J, Butler LH, et al. (2000). "CD164 monoclonal antibodies that block hemopoietic progenitor cell adhesion and proliferation interact with the first mucin domain of the CD164 receptor". J. Immunol. 165 (2): 840—51. doi:10.4049/jimmunol.165.2.840. PMID 10878358.
  • Gudbjartsson DF, Walters GB, Thorleifsson G, et al. (2008). "Many sequence variants affecting diversity of adult human height". Nat. Genet. 40 (5): 609—15. doi:10.1038/ng.122. PMID 18391951. S2CID 3005450.
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Res. 6 (9): 791—806. doi:10.1101/gr.6.9.791. PMID 8889548.
  • Oh JH, Yang JO, Hahn Y, et al. (2005). "Transcriptome analysis of human gastric cancer". Mamm. Genome. 16 (12): 942—54. doi:10.1007/s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.
  • Havens AM, Jung Y, Sun YX, et al. (2006). "The role of sialomucin CD164 (MGC-24v or endolyn) in prostate cancer metastasis". BMC Cancer. 6: 195. doi:10.1186/1471-2407-6-195. PMC 1557671. PMID 16859559.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  • Forde S, Tye BJ, Newey SE, et al. (2007). "Endolyn (CD164) modulates the CXCL12-mediated migration of umbilical cord blood CD133+ cells". Blood. 109 (5): 1825—33. doi:10.1182/blood-2006-05-023028. PMID 17077324.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
  • Hennersdorf F, Florian S, Jakob A, et al. (2005). "Identification of CD13, CD107a, and CD164 as novel basophil-activation markers and dissection of two response patterns in time kinetics of IgE-dependent upregulation". Cell Res. 15 (5): 325—35. doi:10.1038/sj.cr.7290301. PMID 15916720.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400