RB (білок)

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1AD6, 1GH6, 1GUX, 1H25, 1N4M, 1O9K, 1PJM, 2AZE, 2QDJ, 2R7G, 3N5U, 3POM, 4ELJ, 4ELL, 4CRI

Ідентифікатори

Символи

RB1, pRb, RB, retinoblastoma 1, OSRC, PPP1R130, p105-Rb, pp110, Retinoblastoma protein, RB transcriptional corepressor 1, p110-RB1

Зовнішні ІД

OMIM: 614041 MGI: 97874 HomoloGene: 272 GeneCards: RB1

Пов'язані генетичні захворювання

рак сечового міхура, lung small cell carcinoma, familial retinoblastoma^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • phosphoprotein binding • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • androgen receptor binding • identical protein binding • enzyme binding • ubiquitin protein ligase binding • importin-alpha family protein binding • disordered domain specific binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• PML body • SWI/SNF complex • transcription regulator complex • веретено поділу • cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex • Хроматин • клітинне ядро • нуклеоплазма • Rb-E2F complex
Біологічний процес	• negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of mitotic cell cycle • neuron apoptotic process • androgen receptor signaling pathway • ремоделювання хроматину • negative regulation of smoothened signaling pathway • negative regulation of protein kinase activity • cell morphogenesis involved in neuron differentiation • mitotic cell cycle checkpoint signaling • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of macrophage differentiation • cellular response to xenobiotic stimulus • negative regulation of cell cycle • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription, DNA-templated • glial cell apoptotic process • regulation of cohesin loading • regulation of cell cycle • neuron maturation • поділ клітини • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • positive regulation of mitotic metaphase/anaphase transition • GO:1903097, GO:1903098, GO:1903099 regulation of centromere complex assembly • enucleate erythrocyte differentiation • neuron differentiation • regulation of mitotic cell cycle • negative regulation of epithelial cell proliferation • skeletal muscle cell differentiation • sister chromatid biorientation • protein localization to chromosome, centromeric region • клітинний цикл • striated muscle cell differentiation • Ras protein signal transduction • myoblast differentiation • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • neuron projection development • digestive tract development • maintenance of mitotic sister chromatid cohesion • regulation of lipid kinase activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • hepatocyte apoptotic process • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of transcription regulatory region DNA binding • negative regulation of gene expression • regulation of cell growth • tissue homeostasis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • G1/S transition of mitotic cell cycle • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • aortic valve morphogenesis • negative regulation of inflammatory response • positive regulation of extracellular matrix organization • positive regulation of collagen fibril organization • negative regulation of myofibroblast differentiation • диференціація клітин • negative regulation of cold-induced thermogenesis • negative regulation of protein serine/threonine kinase activity • negative regulation of tau-protein kinase activity • negative regulation of apoptotic signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5925


19645

Ensembl


ENSG00000139687


ENSMUSG00000022105

UniProt


P06400


P13405

RefSeq (мРНК)


NM_000321


NM_009029

RefSeq (білок)


NP_000312 NP_000312.2


NP_033055

Локус (UCSC)

Хр. 13: 48.3 – 48.6 Mb

Хр. 14: 73.42 – 73.56 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RB, білок ретинобластоми (англ. RB transcriptional corepressor 1) — білок, який кодується геном супресором пухлин RB1, розташованим у людини на довгому плечі 13-ї хромосоми^[4]. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 928 амінокислот, а молекулярна маса — 106 159^[5]. Уперше виявлений під час вивчення спадкової форми раку сітківки у дітей — ретинобластоми, через що й отримав свою назву. Його функцією є стримання клітинного циклу, зокрема проходження через точку контролю G₁/S. Проте втрата обидвох робочих копій гена Rb не одразу призводить до надмірної проліферації й виникнення пухлин сітківки та інших тканин, оскільки існують допоміжні механізми зупинки клітинного циклу в тій же фазі^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPPKTPRKTA	ATAAAAAAEP	PAPPPPPPPE	EDPEQDSGPE	DLPLVRLEFE
ETEEPDFTAL	CQKLKIPDHV	RERAWLTWEK	VSSVDGVLGG	YIQKKKELWG
ICIFIAAVDL	DEMSFTFTEL	QKNIEISVHK	FFNLLKEIDT	STKVDNAMSR
LLKKYDVLFA	LFSKLERTCE	LIYLTQPSSS	ISTEINSALV	LKVSWITFLL
AKGEVLQMED	DLVISFQLML	CVLDYFIKLS	PPMLLKEPYK	TAVIPINGSP
RTPRRGQNRS	ARIAKQLEND	TRIIEVLCKE	HECNIDEVKN	VYFKNFIPFM
NSLGLVTSNG	LPEVENLSKR	YEEIYLKNKD	LDARLFLDHD	KTLQTDSIDS
FETQRTPRKS	NLDEEVNVIP	PHTPVRTVMN	TIQQLMMILN	SASDQPSENL
ISYFNNCTVN	PKESILKRVK	DIGYIFKEKF	AKAVGQGCVE	IGSQRYKLGV
RLYYRVMESM	LKSEEERLSI	QNFSKLLNDN	IFHMSLLACA	LEVVMATYSR
STSQNLDSGT	DLSFPWILNV	LNLKAFDFYK	VIESFIKAEG	NLTREMIKHL
ERCEHRIMES	LAWLSDSPLF	DLIKQSKDRE	GPTDHLESAC	PLNLPLQNNH
TAADMYLSPV	RSPKKKGSTT	RVNSTANAET	QATSAFQTQK	PLKSTSLSLF
YKKVYRLAYL	RLNTLCERLL	SEHPELEHII	WTLFQHTLQN	EYELMRDRHL
DQIMMCSMYG	ICKVKNIDLK	FKIIVTAYKD	LPHAVQETFK	RVLIKEEEYD
SIIVFYNSVF	MQRLKTNILQ	YASTRPPTLS	PIPHIPRSPY	KFPSSPLRIP
GGNIYISPLK	SPYKISEGLP	TPTKMTPRSR	ILVSIGESFG	TSEKFQKINQ
MVCNSDRVLK	RSAEGSNPPK	PLKKLRFDIE	GSDEADGSKH	LPGESKFQQK
LAEMTSTRTR	MQKQKMNDSM	DTSNKEEK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, регуляція транскрипції, ацетилювання та метилювання хроматину. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Функція

Білок Rb виконує свою функцію шляхом зв'язування та інактивації групи транскрипційних факторів E2F. Ці білки в активному стані приєднуються до специфічних послідовностей у промоторних ділянках широкого спектра генів, продукти яких необхідні для проходження S-фази клітинного циклу, зокрема такі як G₁/S-цикліни, S-цикліни, ферменти та інші білки, необхідні для реплікації ДНК і подвоєння хромосом. За браку мітогенних стимулів Rb пригнічує активність білків E2F і не пропускає клітину в S-фазу^[6].

Коли клітина отримує сигнал, який спонукає її до поділу, у ній накопичуються G₁-циклін-залежні кінази, які фосфорилюють Rb і переводять його в неактивну форму. У такому разі інгібування знімається із факторів транскрипції E2F, і вони можуть запускати S-фазу^[6].

Роль у пухлинах

Ген Rb був виявлений під час вивчення рідкісного спадкового захворювання — ретинобластоми. Для деяких особин з цією хворобою, характерний візуально аномальний каріотип: у них бракує однієї специфічної смуги на 13-й хромосомі. Делеція тієї ж ділянки спостерігається у деяких пацієнтів із неспадковою формою захворювання. Ці дані дозволили клонувати ген Rb. Було з'ясовано, що в людей, уражених спадковою формою ретинобластоми, цей ген делетований або в ньому відбулась мутація, яка призвела до втрати функції, в одній із двох копій 13-ї хромосоми в кожній соматичній клітині. Такі клітини є більш схильними до злоякісного переродження, проте воно відбувається тільки в разі інактивації нормальної копії гена Rb^[7]. Це може статися шляхом втрати однієї хромосоми з подальшою дуплікацією хромосоми із мутантним або делетованим геном, мітотичної рекомбінації, конверсії генів, делеції або точкової мутації^[8]. Такі події трапляються з частотою, що дозволяє незалежне виникнення великої кількості пухлин в обидвох очах^[7].

Неспадкова форма ретинобластоми трапляється дуже рідко, оскільки для її виникнення необхідна інактивація обидвох нормальних копій гена Rb. При цьому виникає тільки одна пухлина в одному оці. Функціонального Rb також бракує у кількох інших типах ракових захворювань, зокрема карциномах легень, молочної залози, сечового міхура. Ці злоякісні пухлини виникають внаслідок складнішої серії генетичних змін ніж ретинобластома і з'являються пізніше у житті людини^[7]. У багатьох інших типах злоякісних новоутворень сигнальний шлях Rb інактивується через зміни в роботі інших його компонентів^[9].

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9884 (англ.) . Архів оригіналу за 3 травня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.
↑ UniProt, P06400 (англ.) . Архів оригіналу за 2 травня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.
↑ ^а ^б ^в Alberts et al, 2007, с. 1103—1105.
↑ ^а ^б ^в Alberts et al, 2007, с. 1234.
↑ Alberts et al, 2007, с. 1236.
↑ Alberts et al, 2007, с. 1243.

Джерела

Alberts B, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P (2007). Molecular Biology of the Cell (вид. 5th). Garland Science. ISBN 978-0-8153-4105-5. Архів оригіналу за 22 липня 2011. Процитовано 12 листопада 2012.

Література

McGee T.L., Yandell D.W., Dryja T.P. (1989). Structure and partial genomic sequence of the human retinoblastoma susceptibility gene. Gene. 80: 119—128. PMID 2701949 DOI:10.1016/0378-1119(89)90256-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lohmann D.R., Brandt B., Hopping W., Passarge E., Horsthemke B. (1994). Spectrum of small length germline mutations in the RB1 gene. Hum. Mol. Genet. 3: 2187—2193. PMID 7881418 DOI:10.1093/hmg/3.12.2187
Meyerson M., Harlow E. (1994). Identification of G1 kinase activity for cdk6, a novel cyclin D partner. Mol. Cell. Biol. 14: 2077—2086. PMID 8114739 DOI:10.1128/MCB.14.3.2077
Durfee T., Mancini M.A., Jones D., Elledge S.J., Lee W.H. (1994). The amino-terminal region of the retinoblastoma gene product binds a novel nuclear matrix protein that co-localizes to centers for RNA processing. J. Cell Biol. 127: 609—622. PMID 7525595 DOI:10.1083/jcb.127.3.609
Kim Y.W., Otterson G.A., Kratzke R.A., Coxon A.B., Kaye F.J. (1994). Differential specificity for binding of retinoblastoma binding protein 2 to RB, p107, and TATA-binding protein. Mol. Cell. Biol. 14: 7256—7264. PMID 7935440 DOI:10.1128/MCB.14.11.7256

Див. також

Хромосома 13

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма