HCN4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2MNG, 3OTF, 3U11, 4HBN, 4KL1, 4NVP

Ідентифікатори

Символи

HCN4, SSS2, hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4, BRGDA8, EIG18

Зовнішні ІД

OMIM: 605206 MGI: 1298209 HomoloGene: 3997 GeneCards: HCN4

Пов'язані генетичні захворювання

Brugada syndrome 8, миготіння передсердь^[1]

Реагує на сполуку

івабрадин^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • potassium channel activity • cAMP binding • sodium channel activity • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • intracellular cAMP-activated cation channel activity • identical protein binding • voltage-gated potassium channel activity • voltage-gated sodium channel activity • voltage-gated potassium channel activity involved in SA node cell action potential depolarization
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • intrinsic component of plasma membrane • клітинна мембрана • perinuclear region of cytoplasm • HCN channel complex
Біологічний процес	• cellular response to cGMP • м'язове скорочення • sodium ion transmembrane transport • sodium ion transport • SA node cell action potential • regulation of membrane potential • regulation of ion transmembrane transport • cation transport • ion transport • кровообіг • regulation of membrane depolarization • регуляція серцевого ритму • potassium ion transport • трансмембранний транспорт • potassium ion transmembrane transport • regulation of cardiac muscle contraction • regulation of heart rate by cardiac conduction • cellular response to cAMP • membrane depolarization during cardiac muscle cell action potential • membrane depolarization during SA node cell action potential • sodium ion import across plasma membrane • regulation of cardiac muscle cell action potential involved in regulation of contraction • potassium ion import across plasma membrane
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10021


330953

Ensembl


ENSG00000138622


ENSMUSG00000032338

UniProt


Q9Y3Q4


O70507

RefSeq (мРНК)


NM_005477


NM_001081192

RefSeq (білок)


NP_005468


NP_001074661

Локус (UCSC)

Хр. 15: 73.32 – 73.37 Mb

Хр. 9: 58.73 – 58.77 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HCN4 (англ. Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 203 амінокислот, а молекулярна маса — 129 042^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDKLPPSMRK	RLYSLPQQVG	AKAWIMDEEE	DAEEEGAGGR	QDPSRRSIRL
RPLPSPSPSA	AAGGTESRSS	ALGAADSEGP	ARGAGKSSTN	GDCRRFRGSL
ASLGSRGGGS	GGTGSGSSHG	HLHDSAEERR	LIAEGDASPG	EDRTPPGLAA
EPERPGASAQ	PAASPPPPQQ	PPQPASASCE	QPSVDTAIKV	EGGAAAGDQI
LPEAEVRLGQ	AGFMQRQFGA	MLQPGVNKFS	LRMFGSQKAV	EREQERVKSA
GFWIIHPYSD	FRFYWDLTML	LLMVGNLIII	PVGITFFKDE	NTTPWIVFNV
VSDTFFLIDL	VLNFRTGIVV	EDNTEIILDP	QRIKMKYLKS	WFMVDFISSI
PVDYIFLIVE	TRIDSEVYKT	ARALRIVRFT	KILSLLRLLR	LSRLIRYIHQ
WEEIFHMTYD	LASAVVRIVN	LIGMMLLLCH	WDGCLQFLVP	MLQDFPDDCW
VSINNMVNNS	WGKQYSYALF	KAMSHMLCIG	YGRQAPVGMS	DVWLTMLSMI
VGATCYAMFI	GHATALIQSL	DSSRRQYQEK	YKQVEQYMSF	HKLPPDTRQR
IHDYYEHRYQ	GKMFDEESIL	GELSEPLREE	IINFNCRKLV	ASMPLFANAD
PNFVTSMLTK	LRFEVFQPGD	YIIREGTIGK	KMYFIQHGVV	SVLTKGNKET
KLADGSYFGE	ICLLTRGRRT	ASVRADTYCR	LYSLSVDNFN	EVLEEYPMMR
RAFETVALDR	LDRIGKKNSI	LLHKVQHDLN	SGVFNYQENE	IIQQIVQHDR
EMAHCAHRVQ	AAASATPTPT	PVIWTPLIQA	PLQAAAATTS	VAIALTHHPR
LPAAIFRPPP	GSGLGNLGAG	QTPRHLKRLQ	SLIPSALGSA	SPASSPSQVD
TPSSSSFHIQ	QLAGFSAPAG	LSPLLPSSSS	SPPPGACGSP	SAPTPSAGVA
ATTIAGFGHF	HKALGGSLSS	SDSPLLTPLQ	PGARSPQAAQ	PSPAPPGARG
GLGLPEHFLP	PPPSSRSPSS	SPGQLGQPPG	ELSLGLATGP	LSTPETPPRQ
PEPPSLVAGA	SGGASPVGFT	PRGGLSPPGH	SPGPPRTFPS	APPRASGSHG
SLLLPPASSP	PPPQVPQRRG	TPPLTPGRLT	QDLKLISASQ	PALPQDGAQT
LRRASPHSSG	ESMAAFPLFP	RAGGGSGGSG	SSGGLGPPGR	PYGAIPGQHV
TLPRKTSSGS	LPPPLSLFGA	RATSSGGPPL	TAGPQREPGA	RPEPVRSKLP
SNL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, транспорт натрію. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, калію, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Xu X., Vysotskaya Z.V., Liu Q., Zhou L. (2010). Structural basis for the cAMP-dependent gating in the human HCN4 channel. J. Biol. Chem. 285: 37082—37091. PMID 20829353 DOI:10.1074/jbc.M110.152033
Milanesi R., Baruscotti M., Gnecchi-Ruscone T., DiFrancesco D. (2006). Familial sinus bradycardia associated with a mutation in the cardiac pacemaker channel. N. Engl. J. Med. 354: 151—157. PMID 16407510 DOI:10.1056/NEJMoa052475

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HCN4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16882 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y3Q4 (англ.) . Архів оригіналу за 11 березня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані