EIF6

EIF6
Ідентифікатори
Символи EIF6, CAB, EIF3A, ITGB4BP, b(2)gcn, eIF-6, p27(BBP), p27BBP, eukaryotic translation initiation factor 6
Зовнішні ІД OMIM: 602912 MGI: 1196288 HomoloGene: 7135 GeneCards: EIF6
Онтологія гена
Молекулярна функція

ribosome binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
translation initiation factor activity
ribosomal large subunit binding

Клітинна компонента

цитоплазма
екзосома
клітинне ядро
нуклеоплазма
ядерце
гіалоплазма
preribosome, large subunit precursor
lamin filament
Проміжні філаменти

Біологічний процес

translational initiation
mature ribosome assembly
Біосинтез білків
ribosome biogenesis
response to insulin
maturation of LSU-rRNA
gene silencing by miRNA
regulation of glycolytic process
assembly of large subunit precursor of preribosome
maturation of 5.8S rRNA
regulation of fatty acid biosynthetic process
GO:1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process
positive regulation of translation
regulation of megakaryocyte differentiation
miRNA-mediated gene silencing by inhibition of translation
ribosomal subunit export from nucleus
ribosomal large subunit biogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3692
16418
Ensembl
ENSG00000242372
ENSMUSG00000027613
UniProt
P56537
O55135
RefSeq (мРНК)
NM_001267810
NM_002212
NM_181466
NM_181467
NM_181468
NM_181469
NM_010579
RefSeq (білок)
NP_001254739
NP_002203
NP_852131
NP_852133
NP_034709
Локус (UCSC) Хр. 20: 35.28 – 35.28 Mb Хр. 2: 155.66 – 155.67 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EIF6 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 245 амінокислот, а молекулярна маса — 26 599[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAVRASFENNCEIGCFAKLTNTYCLVAIGGSENFYSVFEGELSDTIPVVH
ASIAGCRIIGRMCVGNRHGLLVPNNTTDQELQHIRNSLPDTVQIRRVEER
LSALGNVTTCNDYVALVHPDLDRETEEILADVLKVEVFRQTVADQVLVGS
YCVFSNQGGLVHPKTSIEDQDELSSLLQVPLVAGTVNRGSEVIAAGMVVN
DWCAFCGLDTTSTELSVVESVFKLNEAQPSTIATSMRDSLIDSLT

Кодований геном білок за функцією належить до факторів ініціації. Задіяний у таких біологічних процесах як біосинтез білка, біогенез рибосом. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Si K., Chaudhuri J., Chevesich J., Maitra U. (1997). Molecular cloning and functional expression of a human cDNA encoding translation initiation factor 6. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 14285—14290. PMID 9405604 DOI:10.1073/pnas.94.26.14285
  • Donadini A., Giodini A., Sanvito F., Marchisio P.C., Biffo S. (2001). The human ITGB4BP gene is constitutively expressed in vitro, but highly modulated in vivo. Gene. 266: 35—43. PMID 11290417 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00370-5
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Basu U., Si K., Deng H., Maitra U. (2003). Phosphorylation of mammalian eukaryotic translation initiation factor 6 and its Saccharomyces cerevisiae homologue Tif6p: evidence that phosphorylation of Tif6p regulates its nucleocytoplasmic distribution and is required for yeast cell growth. Mol. Cell. Biol. 23: 6187—6199. PMID 12917340 DOI:10.1128/MCB.23.17.6187-6199.2003

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6159 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.
  4. UniProt, P56537 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 20
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)
Білки
Фактори ініціації трансляції
Фактори ініціації трансляції прокаріотів
  • PIF-1
  • PIF-2
  • PIF-3
Фактори ініціації трансляції археїв
  • aIF1
  • aIF2
  • aIF5
  • aIF6
Фактори ініціації трансляції еукаріотів
eIF1
eIF2
eIF3
eIF4
eIF5
eIF6
  • EIF6
Фактори елонгації трансляції
Фактори елонгації трансляції прокаріотів
  • EF-Tu
  • EF-Ts
  • EF-G
Фактори елонгації трансляції археїв
  • aEF-1, aEF-2
Фактори елонгації трансляції еукаріотів
Фактори термінації трансляції
  • Фактори термінації трансляції прокаріотів
  • Фактори термінації трансляції археїв
  • Фактори термінації трансляції еукаріотів
Рибосомні білки
Цитоплазмові
підрозділ 60S
підрозділ 40S
Мітохондріальні
підрозділ 39S
підрозділ 28S