| EIF4G3 |
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | EIF4G3, eIF-4G 3, eIF4G 3, eIF4GII, eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 603929 MGI: 1923935 HomoloGene: 2789 GeneCards: EIF4G3 |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • RNA cap binding
• translation factor activity, RNA binding
• translation initiation factor activity
• RNA binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• mRNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • гіалоплазма
• eukaryotic translation initiation factor 4F complex
|
|---|
| Біологічний процес | • translational initiation
• GO:0022415 viral process
• Біосинтез білків
• regulation of translation
• regulation of translational initiation
• negative regulation of autophagy
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | NM_001198801
NM_001198802
NM_001198803
NM_003760
NM_001391892
| NM_001391893
NM_001391894
NM_001391895
NM_001391896
NM_001391897
NM_001391898
NM_001391899
NM_001391900
NM_001391901
NM_001391902
NM_001391903
NM_001391904
NM_001391905
NM_001391906
NM_001391907 |
| | NM_001256195
NM_001256198
NM_172703
NM_001355699
NM_001355700 |
|
|---|
| RefSeq (білок) | | NP_001185730
NP_001185731
NP_001185732
NP_003751 |
| NP_001243124
NP_001243127
NP_766291
NP_001342628
NP_001342629
| NP_001356059
NP_001356060 |
|
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 1: 20.81 – 21.18 Mb | Хр. 4: 137.99 – 138.21 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EIF4G3 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 585 амінокислот, а молекулярна маса — 176 652[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MNSQPQTRSP | | FFQRPQIQPP | | RATIPNSSPS | | IRPGAQTPTA | | VYQANQHIMM |
| VNHLPMPYPV | | PQGPQYCIPQ | | YRHSGPPYVG | | PPQQYPVQPP | | GPGPFYPGPG |
| PGDFPNAYGT | | PFYPSQPVYQ | | SAPIIVPTQQ | | QPPPAKREKK | | TIRIRDPNQG |
| GKDITEEIMS | | GGGSRNPTPP | | IGRPTSTPTP | | PQQLPSQVPE | | HSPVVYGTVE |
| SAHLAASTPV | | TAASDQKQEE | | KPKPDPVLKS | | PSPVLRLVLS | | GEKKEQEGQT |
| SETTAIVSIA | | ELPLPPSPTT | | VSSVARSTIA | | APTSSALSSQ | | PIFTTAIDDR |
| CELSSPREDT | | IPIPSLTSCT | | ETSDPLPTNE | | NDDDICKKPC | | SVAPNDIPLV |
| SSTNLINEIN | | GVSEKLSATE | | SIVEIVKQEV | | LPLTLELEIL | | ENPPEEMKLE |
| CIPAPITPST | | VPSFPPTPPT | | PPASPPHTPV | | IVPAAATTVS | | SPSAAITVQR |
| VLEEDESIRT | | CLSEDAKEIQ | | NKIEVEADGQ | | TEEILDSQNL | | NSRRSPVPAQ |
| IAITVPKTWK | | KPKDRTRTTE | | EMLEAELELK | | AEEELSIDKV | | LESEQDKMSQ |
| GFHPERDPSD | | LKKVKAVEEN | | GEEAEPVRNG | | AESVSEGEGI | | DANSGSTDSS |
| GDGVTFPFKP | | ESWKPTDTEG | | KKQYDREFLL | | DFQFMPACIQ | | KPEGLPPISD |
| VVLDKINQPK | | LPMRTLDPRI | | LPRGPDFTPA | | FADFGRQTPG | | GRGVPLLNVG |
| SRRSQPGQRR | | EPRKIITVSV | | KEDVHLKKAE | | NAWKPSQKRD | | SQADDPENIK |
| TQELFRKVRS | | ILNKLTPQMF | | NQLMKQVSGL | | TVDTEERLKG | | VIDLVFEKAI |
| DEPSFSVAYA | | NMCRCLVTLK | | VPMADKPGNT | | VNFRKLLLNR | | CQKEFEKDKA |
| DDDVFEKKQK | | ELEAASAPEE | | RTRLHDELEE | | AKDKARRRSI | | GNIKFIGELF |
| KLKMLTEAIM | | HDCVVKLLKN | | HDEESLECLC | | RLLTTIGKDL | | DFEKAKPRMD |
| QYFNQMEKIV | | KERKTSSRIR | | FMLQDVIDLR | | LCNWVSRRAD | | QGPKTIEQIH |
| KEAKIEEQEE | | QRKVQQLMTK | | EKRRPGVQRV | | DEGGWNTVQG | | AKNSRVLDPS |
| KFLKITKPTI | | DEKIQLVPKA | | QLGSWGKGSS | | GGAKASETDA | | LRSSASSLNR |
| FSALQPPAPS | | GSTPSTPVEF | | DSRRTLTSRG | | SMGREKNDKP | | LPSATARPNT |
| FMRGGSSKDL | | LDNQSQEEQR | | REMLETVKQL | | TGGVDVERNS | | TEAERNKTRE |
| SAKPEISAMS | | AHDKAALSEE | | ELERKSKSII | | DEFLHINDFK | | EAMQCVEELN |
| AQGLLHVFVR | | VGVESTLERS | | QITRDHMGQL | | LYQLVQSEKL | | SKQDFFKGFS |
| ETLELADDMA | | IDIPHIWLYL | | AELVTPMLKE | | GGISMRELTI | | EFSKPLLPVG |
| RAGVLLSEIL | | HLLCKQMSHK | | KVGALWREAD | | LSWKDFLPEG | | EDVHNFLLEQ |
| KLDFIESDSP | | CSSEALSKKE | | LSAEELYKRL | | EKLIIEDKAN | | DEQIFDWVEA |
| NLDEIQMSSP | | TFLRALMTAV | | CKAAIIADSS | | TFRVDTAVIK | | QRVPILLKYL |
| DSDTEKELQA | | LYALQASIVK | | LDQPANLLRM | | FFDCLYDEEV | | ISEDAFYKWE |
| SSKDPAEQNG | | KGVALKSVTA | | FFTWLREAEE | | ESEDN |
Кодований геном білок за функціями належить до факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, взаємодія хазяїн-вірус, біосинтез білка, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Imataka H., Gradi A., Sonenberg N. (1998). A newly identified N-terminal amino acid sequence of human eIF4G binds poly(A)-binding protein and functions in poly(A)-dependent translation. EMBO J. 17: 7480—7489. PMID 9857202 DOI:10.1093/emboj/17.24.7480
- Qin H., Raught B., Sonenberg N., Goldstein E.G., Edelman A.M. (2003). Phosphorylation screening identifies translational initiation factor 4GII as an intracellular target of Ca(2+)/calmodulin-dependent protein kinase I. J. Biol. Chem. 278: 48570—48579. PMID 14507913 DOI:10.1074/jbc.M308781200
- Gingras A.-C., Raught B., Sonenberg N. (1999). eIF4 initiation factors: effectors of mRNA recruitment to ribosomes and regulators of translation. Annu. Rev. Biochem. 68: 913—963. PMID 10872469 DOI:10.1146/annurev.biochem.68.1.913
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Miura T., Shiratori Y., Shimma N. (2003). Backbone resonance assignment of human eukaryotic translation initiation factor 4E (eIF4E) in complex with 7-methylguanosine diphosphate (m7GDP) and a 17-amino acid peptide derived from human eIF4GII. J. Biomol. NMR. 27: 279—280. PMID 12975586 DOI:10.1023/A:1025442322316
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3298 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O43432 (англ.) . Архів оригіналу за 9 березня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
| |
|---|
| | Білки | | Фактори ініціації трансляції | | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
|---|
| | Фактори ініціації трансляції археїв | |
|---|
| | Фактори ініціації трансляції еукаріотів | | eIF1 | |
|---|
| | eIF2 | |
|---|
| | eIF3 | |
|---|
| | eIF4 | |
|---|
| | eIF5 | |
|---|
| | eIF6 | |
|---|
|
|---|
|
|---|
| | Фактори елонгації трансляції | | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
|---|
| | Фактори елонгації трансляції археїв | |
|---|
| | Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
|---|
|
|---|
| | Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
|---|
| | Рибосомні білки | | Цитоплазмові | | підрозділ 60S | |
|---|
| | підрозділ 40S | |
|---|
|
|---|
| | Мітохондріальні | | підрозділ 39S | |
|---|
| | підрозділ 28S | |
|---|
|
|---|
|
|---|
|
|---|
|
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
