SYT9 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SYT9

Ідентифікатори

Символи

SYT9, synaptotagmin 9

Зовнішні ІД

OMIM: 613528 MGI: 1926373 HomoloGene: 11062 GeneCards: SYT9

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium-dependent phospholipid binding • зв'язування з іоном металу • clathrin binding • calcium ion binding • syntaxin binding • identical protein binding • phosphatidylserine binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • SNARE binding
Клітинна компонента	• GO:0016023 cytoplasmic vesicle • integral component of membrane • міжклітинні контакти • синапс • dense core granule • synaptic vesicle membrane • secretory granule membrane • мембрана • secretory granule • клітинна мембрана • clathrin-coated vesicle membrane • integral component of synaptic vesicle membrane • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse • exocytic vesicle
Біологічний процес	• regulation of insulin secretion • positive regulation of calcium ion-dependent exocytosis • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • vesicle fusion • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • membrane organization • calcium-dependent activation of synaptic vesicle fusion • regulation of dopamine secretion • synaptic vesicle exocytosis • vesicle-mediated transport • calcium-ion regulated exocytosis • cellular response to calcium ion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


143425


60510

Ensembl


ENSG00000170743


ENSMUSG00000062542

UniProt


Q86SS6


Q9R0N9

RefSeq (мРНК)


NM_175733


NM_021889

RefSeq (білок)


NP_783860


NP_068689

Локус (UCSC)

Хр. 11: 7.24 – 7.47 Mb

Хр. 7: 106.97 – 107.15 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYT9 (англ. Synaptotagmin 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 491 амінокислот, а молекулярна маса — 56 188^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPGARDALCH	QALQLLAELC	ARGALEHDSC	QDFIYHLRDR	ARPRLRDPDI
SVSLLTLVVT	ACGLALFGVS	LFVSWKLCWV	PWRERGLPSG	SKDNNQEPLN
YMDTETNEQE	NSEDFLDPPT	PCPDSSMKIS	HTSPDIPLST	QTGIQENCAH
GVRVQRQVTE	PTSSARHNSI	RRQLNLSNPD	FNIQQLQKQE	QLTGIGRIKP
ELYKQRSLDN	DDGRRSNSKA	CGKLNFILKY	DCDLEQLIVK	IHKAVNLPAK
DFSGTSDPYV	KIYLLPDRKT	KHQTKVHRKT	LNPVFDEVFL	FPVPYNDLEA
RKLHFSVYDF	DRFSRHDLIG	QVVVDHFLDL	ADFPRECILW	KDIEYVTNDN
VDLGELMFSL	CYLPTAGRLT	ITIIKARNLK	AMDITGASDP	YVKVSLMCDG
RRLKKRKTST	KRNTLNPVYN	EAIVFDVPPE	NIDQIHLSIA	VMDYDRVGHN
EIIGVCQVGN	EAERLGRDHW	SEMLSYPRKP	IAHWHSLVEK	R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19265 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q86SS6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.