PTPRC

PTPRC
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1YGU, 1YGR, 5FMV, 5FN6, 5FN7

Ідентифікатори
Символи PTPRC, B220, CD45, CD45R, GP180, L-CA, LCA, LY5, T200, protein tyrosine phosphatase, receptor type C, protein tyrosine phosphatase receptor type C
Зовнішні ІД OMIM: 151460 MGI: 97810 HomoloGene: 2126 GeneCards: PTPRC
Пов'язані генетичні захворювання
неспецифічний виразковий коліт[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

phosphoprotein phosphatase activity
GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity
protein kinase binding
hydrolase activity
protein tyrosine phosphatase activity

Клітинна компонента

integral component of membrane
мембрана
focal adhesion
клітинна мембрана
integral component of plasma membrane
cell surface
membrane raft
екзосома
external side of plasma membrane
secretory granule membrane

Біологічний процес

B cell receptor signaling pathway
cell cycle phase transition
release of sequestered calcium ion into cytosol
negative regulation of protein kinase activity
bone marrow development
stem cell development
GO:0016576 protein dephosphorylation
negative regulation of cytokine-mediated signaling pathway
positive regulation of hematopoietic stem cell migration
regulation of cell cycle
negative regulation of cell adhesion involved in substrate-bound cell migration
negative regulation of T cell mediated cytotoxicity
cell surface receptor signaling pathway
B cell proliferation
T cell differentiation
positive regulation of B cell proliferation
defense response to virus
positive regulation of T cell proliferation
hematopoietic progenitor cell differentiation
positive regulation of antigen receptor-mediated signaling pathway
T cell receptor signaling pathway
positive regulation of stem cell proliferation
GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання
positive regulation of protein kinase activity
peptidyl-tyrosine dephosphorylation
neutrophil degranulation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5788
19264
Ensembl
ENSG00000081237
ENSG00000262418
ENSMUSG00000026395
UniProt
P08575
P06800
RefSeq (мРНК)
NM_001267798
NM_002838
NM_080921
NM_080922
NM_001111316
NM_001268286
NM_011210
RefSeq (білок)
NP_001254727
NP_002829
NP_563578
NP_563578.2
NP_002829.3
NP_001104786
NP_001255215
NP_035340
Локус (UCSC) Хр. 1: 198.64 – 198.76 Mb Хр. 1: 137.99 – 138.1 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PTPRC (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 304 амінокислот, а молекулярна маса — 147 254[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MYLWLKLLAFGFAFLDTEVFVTGQSPTPSPTGLTTAKMPSVPLSSDPLPT
HTTAFSPASTFERENDFSETTTSLSPDNTSTQVSPDSLDNASAFNTTGVS
SVQTPHLPTHADSQTPSAGTDTQTFSGSAANAKLNPTPGSNAISDVPGER
STASTFPTDPVSPLTTTLSLAHHSSAALPARTSNTTITANTSDAYLNASE
TTTLSPSGSAVISTTTIATTPSKPTCDEKYANITVDYLYNKETKLFTAKL
NVNENVECGNNTCTNNEVHNLTECKNASVSISHNSCTAPDKTLILDVPPG
VEKFQLHDCTQVEKADTTICLKWKNIETFTCDTQNITYRFQCGNMIFDNK
EIKLENLEPEHEYKCDSEILYNNHKFTNASKIIKTDFGSPGEPQIIFCRS
EAAHQGVITWNPPQRSFHNFTLCYIKETEKDCLNLDKNLIKYDLQNLKPY
TKYVLSLHAYIIAKVQRNGSAAMCHFTTKSAPPSQVWNMTVSMTSDNSMH
VKCRPPRDRNGPHERYHLEVEAGNTLVRNESHKNCDFRVKDLQYSTDYTF
KAYFHNGDYPGEPFILHHSTSYNSKALIAFLAFLIIVTSIALLVVLYKIY
DLHKKRSCNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRL
FLAEFQSIPRVFSKFPIKEARKPFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGD
AGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVDDFWRMIWEQKATVIVMVT
RCEEGNRNKCAEYWPSMEEGTRAFGDVVVKINQHKRCPDYIIQKLNIVNK
KEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVH
CSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENKVDVYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQY
ILIHQALVEYNQFGETEVNLSELHPYLHNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLP
SYRSWRTQHIGNQEENKSKNRNSNVIPYDYNRVPLKHELEMSKESEHDSD
ESSDDDSDSEEPSKYINASFIMSYWKPEVMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQ
RKVKVIVMLTELKHGDQEICAQYWGEGKQTYGDIEVDLKDTDKSSTYTLR
VFELRHSKRKDSRTVYQYQYTNWSVEQLPAEPKELISMIQVVKQKLPQKN
SSEGNKHHKSTPLLIHCRDGSQQTGIFCALLNLLESAETEEVVDIFQVVK
ALRKARPGMVSTFEQYQFLYDVIASTYPAQNGQVKKNNHQEDKIEFDNEV
DKVKQDANCVNPLGAPEKLPEAKEQAEGSEPTSGTEGPEHSVNGPASPAL
NQGS

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз. Локалізований у мембрані.

Література

  • Streuli M., Hall L.R., Saga Y., Schlossman S.F., Saito H. (1987). Differential usage of three exons generates at least five different mRNAs encoding human leukocyte common antigens. J. Exp. Med. 166: 1548—1566. PMID 2824653 DOI:10.1084/jem.166.5.1548
  • Tsai A.Y.M., Streuli M., Saito H. (1989). Integrity of the exon 6 sequence is essential for tissue-specific alternative splicing of human leukocyte common antigen pre-mRNA. Mol. Cell. Biol. 9: 4550—4555. PMID 2531281 DOI:10.1128/MCB.9.10.4550
  • Charbonneau H., Tonks N.K., Walsh K.A., Fischer E.H. (1988). The leukocyte common antigen (CD45): a putative receptor-linked protein tyrosine phosphatase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 7182—7186. PMID 2845400 DOI:10.1073/pnas.85.19.7182
  • Wu L., Fu J., Shen S.-H. (2002). SKAP55 coupled with CD45 positively regulates T-cell receptor-mediated gene transcription. Mol. Cell. Biol. 22: 2673—2686. PMID 11909961 DOI:10.1128/MCB.22.8.2673-2686.2002
  • Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
  • Nam H.J., Poy F., Saito H., Frederick C.A. (2005). Structural basis for the function and regulation of the receptor protein tyrosine phosphatase CD45. J. Exp. Med. 201: 441—452. PMID 15684325 DOI:10.1084/jem.20041890

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з PTPRC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9666 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
  5. UniProt, P08575 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350