CDK5R1

CDK5R1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1H4L, 1UNG, 1UNH, 1UNL, 3O0G

Идентификаторы
ПсевдонимыCDK5R1, CDK5P35, CDK5R, NCK5A, p23, p25, p35, p35nck5a, cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35), cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1
Внешние IDOMIM: 603460 MGI: 101764 HomoloGene: 31200 GeneCards: CDK5R1
Расположение гена (человек)
17-я хромосома человека
Хр.17-я хромосома человека[1]
17-я хромосома человека
Расположение в геноме CDK5R1
Расположение в геноме CDK5R1
Локус17q11.2Начало32,486,993 bp[1]
Конец32,491,253 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
11-я хромосома мыши
Хр.11-я хромосома мыши[2]
11-я хромосома мыши
Расположение в геноме CDK5R1
Расположение в геноме CDK5R1
Локус11 B5|11 47.94 cMНачало80,367,849 bp[2]
Конец80,372,010 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • Region I of hippocampus proper

  • цитоархитектоническое поле Бродмана 23

  • ventricular zone

  • цитоархитектоническое поле Бродмана 9
Наибольшая экспрессия в
  • medial dorsal nucleus

  • medial ganglionic eminence

  • olfactory tubercle

  • medial geniculate nucleus

  • lateral septal nucleus
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • protein kinase activity
  • calcium ion binding
  • ephrin receptor binding
  • cadherin binding
  • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity
  • kinase activity
  • связывание с белками плазмы
  • protein kinase binding
  • protein serine/threonine kinase activator activity
  • protease binding
  • actin binding
  • ionotropic glutamate receptor binding
  • alpha-tubulin binding
  • beta-tubulin binding
  • actin filament binding
  • protein kinase activator activity
Компонент клетки
  • цитоплазма
  • цитозоль
  • мембрана
  • постсинаптическое уплотнение
  • intracellular membrane-bounded organelle
  • Конус роста
  • нервно-мышечный синапс
  • дендритный шипик
  • аксон
  • neuronal cell body
  • дендрит
  • protein kinase 5 complex
  • perinuclear region of cytoplasm
  • сократительные волокна
  • клеточное ядро
  • нуклеоплазма
  • клеточная мембрана
  • микротрубочка
  • neuron projection
  • пресинапс
Биологический процесс
  • positive regulation of protein kinase activity
  • regulation of neuron differentiation
  • G protein-coupled acetylcholine receptor signaling pathway
  • regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
  • regulation of actin cytoskeleton organization
  • embryo development
  • ритмический процесс
  • ephrin receptor signaling pathway
  • neuron cell-cell adhesion
  • regulation of microtubule cytoskeleton organization
  • neuron migration
  • cerebellum development
  • positive regulation of protein serine/threonine kinase activity
  • positive regulation of neuron apoptotic process
  • развитие мозга
  • ionotropic glutamate receptor signaling pathway
  • layer formation in cerebral cortex
  • peptidyl-serine phosphorylation
  • neuron differentiation
  • пролиферация
  • peptidyl-threonine phosphorylation
  • negative regulation of transcription, DNA-templated
  • neuron projection development
  • cerebral cortex radially oriented cell migration
  • axonal fasciculation
  • развитие гиппокампа
  • negative regulation of axon extension
  • regulation of dendritic spine morphogenesis
  • regulation of macroautophagy
  • superior olivary nucleus maturation
  • positive regulation of protein targeting to membrane
  • Аксональное наведение
  • regulation of signal transduction by p53 class mediator
  • serine phosphorylation of STAT protein
  • microtubule cytoskeleton organization
  • embryo development ending in birth or egg hatching
  • positive regulation of microtubule polymerization
  • positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
  • regulation of synaptic vesicle cycle
  • activation of protein kinase activity
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

8851

12569

Ensembl

ENSG00000176749

ENSMUSG00000048895

UniProt

Q15078

P61809

RefSeq (мРНК)

NM_003885

NM_009871

RefSeq (белок)

NP_003876

NP_034001

Локус (UCSC)Chr 17: 32.49 – 32.49 MbChr 11: 80.37 – 80.37 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Регуляторная субъединица 1 циклин-зависимой киназы 5, сокращённо CDK5R1 — один из нейрон-специфичных активаторов CDK5, наряду с CDK5R2. Имеет две формы, p35 и p25. P25 образуется при расщеплении p35 калпаином, при этом белок перемещается от периферии клетки к ядру и околоядерным областям. P25 дерегулирует активность CDK5, продлевая активацию этой киназы и изменяя её клеточное местоположение. У человека кодируется геном CDK5R1[5][6].

При болезни Альцгеймера отмечается избыточное накопление p25 в мозге, что коррелирует с усилением активности CDK5 и может гипотетически сбивать процессы фосфорилирования белка тау, ассоциированного с микротрубочками, способствуя патологическому процессу[6].

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000176749 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000048895 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Tsai L.H., Delalle I., Caviness VS Jr, Chae T., Harlow E. p35 is a neural-specific regulatory subunit of cyclin-dependent kinase 5 (англ.) // Nature : journal. — 1994. — October (vol. 371, no. 6496). — P. 419—423. — doi:10.1038/371419a0. — PMID 8090221.
  6. 1 2 Entrez Gene: CDK5R1 cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35)  (неопр.). Архивировано 23 ноября 2009 года.